Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG16L1Q676U5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms