Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GARNL3Q5VVW2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms