Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF220Q5VTB9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms