Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD3Q5T2D3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD3Q5T2D3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms