Protein–RNA interactions for Protein: Q53S33

BOLA3, BolA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA3Q53S33 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BOLA3Q53S33 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms