Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYTL3Q4VX76 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms