Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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