Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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SP6Q3SY56 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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SP6Q3SY56 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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SP6Q3SY56 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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SP6Q3SY56 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SP6Q3SY56 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SP6Q3SY56 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SP6Q3SY56 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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