Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP13-4Q3LI77 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms