Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TWISTNBQ3B726 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms