Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms