Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

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Length 1,081 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
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ZNF827Q17R98 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF827Q17R98 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF827Q17R98 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF827Q17R98 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF827Q17R98 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
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ZNF827Q17R98 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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ZNF827Q17R98 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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ZNF827Q17R98 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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ZNF827Q17R98 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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ZNF827Q17R98 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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ZNF827Q17R98 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF827Q17R98 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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