Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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