Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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