Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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NRF1Q16656 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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NRF1Q16656 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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NRF1Q16656 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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NRF1Q16656 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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NRF1Q16656 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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NRF1Q16656 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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NRF1Q16656 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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NRF1Q16656 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NRF1Q16656 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NRF1Q16656 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NRF1Q16656 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
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