Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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SGCAQ16586 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SGCAQ16586 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SGCAQ16586 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SGCAQ16586 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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SGCAQ16586 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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SGCAQ16586 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SGCAQ16586 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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