Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCSK7Q16549 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms