Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIX1Q15475 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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