Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYTH1Q15438 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17■□□□□ 0.31
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