Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLR1Q15399 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TLR1Q15399 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
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