Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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UBE3CQ15386 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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