Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCM1Q15154 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms