Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms