Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRD3Q15059 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRD3Q15059 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms