Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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