Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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