Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL19A1Q14993 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms