Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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