Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
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