Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DDX39BQ13838 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms