Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SPTAN1Q13813 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
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