Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms