Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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NAE1Q13564 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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