Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms