Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PMS2P3Q13401 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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