Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SP140Q13342 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SP140Q13342 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SP140Q13342 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP140Q13342 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP140Q13342 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP140Q13342 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SP140Q13342 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP140Q13342 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP140Q13342 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP140Q13342 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP140Q13342 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SP140Q13342 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms