Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRSQ13332 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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PTPRSQ13332 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRSQ13332 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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PTPRSQ13332 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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PTPRSQ13332 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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PTPRSQ13332 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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PTPRSQ13332 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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