Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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