Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms