Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP1-1Q07627 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms