Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CXCL9Q07325 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms