Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNG1Q06432 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms