Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FPGSQ05932 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms