Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms