Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RHDQ02161 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHDQ02161 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RHDQ02161 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHDQ02161 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHDQ02161 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHDQ02161 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHDQ02161 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHDQ02161 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHDQ02161 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHDQ02161 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHDQ02161 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHDQ02161 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHDQ02161 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHDQ02161 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHDQ02161 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms