Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP1Q00587 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms