Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF3P78545 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF3P78545 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELF3P78545 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELF3P78545 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELF3P78545 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELF3P78545 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELF3P78545 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ELF3P78545 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELF3P78545 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELF3P78545 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms