Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms