Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms