Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP12AP54707 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms